Рискну предположить, что это происходит в режиме "ЛОБОВОЕ СТЕКЛО" и "ЛОБОВОЕ-НОГИ", так как в этих режимах Воздух проходит дополнительно через испаритель кондиционера. Для осушения воздуха. Отсюда потери тепла. На форуме есть тема, как отключить кондиционер в режиме "ЛОБОВОЕ".